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L’analyse du génome des Africains met en lumière les migrations anciennes, la sensibilité moderne, la résistance aux maladies

L'analyse Du Génome Des Africains Met En Lumière Les Migrations

L’analyse des génomes de centaines de personnes de toute l’Afrique a mis en lumière les migrations anciennes et la sensibilité et la résistance modernes aux maladies, révélant une diversité génétique inattendue.

Le génome est souvent décrit comme le manuel d’instructions du corps, et le séquençage du génome entier implique une lecture efficace des milliards de bases d’ADN chez un individu.

De nouvelles recherches sur les séquences de plus de 400 personnes du continent africain s’inscrivent dans le cadre d’une tentative de remédier au déséquilibre des données génétiques disponibles dans le monde, dont la plupart proviennent de personnes d’ascendance européenne.

  L'analyse du génome des Africains met en lumière les migrations anciennes, la sensibilité moderne, la résistance aux maladies

À peine 22% des participants à la recherche en génomique sont d’origine non européenne, la majorité des données génétiques disponibles provenant de trois pays seulement: la Grande-Bretagne, les États-Unis et l’Islande. Mais des efforts pour corriger cela sont en cours depuis des années.
Crédit d’image: Pixabay

L’ouvrage, publié mercredi dans la revue La nature, révèle que la Zambie a peut-être été une étape clé dans l’expansion des groupes de langue bantoue.

Et il constate que les populations vivant dans une zone peuvent avoir des vulnérabilités génétiques significativement différentes aux maladies.

« Ce sont des groupes de population qui, pour la plupart, n’ont pas eu leur génome séquencé auparavant », a déclaré Zane Lombard, professeur agrégé de génétique humaine à l’Université de Johannesburg du Witwatersrand, qui a aidé à diriger l’étude.

« Donc, l’ajout à notre base de connaissances est unique, significatif et plus que ce à quoi on pourrait s’attendre avec un échantillon de taille similaire dans d’autres populations », a-t-elle déclaré à l’AFP.

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À bien des égards, nous vivons à l’ère du gène, avec une meilleure compréhension des éléments de base de notre corps qui aident à faire avancer la recherche médicale et le traitement, et à mieux expliquer comment les humains ont évolué et migré dans le monde.

Mais l’image de la variation génétique humaine reste malheureusement incomplète, la diversité mondiale étant loin d’être représentée.

À peine 22% des participants à la recherche en génomique sont d’origine non européenne, la majorité des données génétiques disponibles provenant de trois pays seulement: la Grande-Bretagne, les États-Unis et l’Islande.

Des efforts pour corriger qui sont en cours depuis des années en Afrique et l’équipe de Lombard a travaillé avec un consortium établi pour améliorer la recherche génétique sur le continent afin d’accéder aux séquences du génome entier de 426 personnes inscrites dans des études en cours.

L’échantillon peut sembler relativement petit, mais il représente 50 groupes ethnolinguistiques de 13 pays, dont certains sont étudiés pour la première fois.

Gratter la surface

Parmi les découvertes révélées par le séquençage, il y avait un nombre étonnamment élevé de nouveaux variants dits à un seul nucléotide (SNV), des zones qui diffèrent d’un génome de référence et qui n’avaient pas été précédemment identifiées dans les données de séquence du génome disponibles au public.

« C’est important parce que nous en apprenons davantage sur la variation génétique humaine en général, découvrons plus de différences qui pourraient être liées à des maladies ou des traits à l’avenir, et qui peuvent informer ce que nous savons de la diversité génétique à travers le monde », a déclaré Lombard.

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La découverte des variantes n’est qu’une première étape, mais elle aidera à identifier celles qui peuvent être importantes pour la santé et fournira des données clés sur les différentes vulnérabilités des populations.

«Les Africains sont (souvent) présumés avoir la même sensibilité ou incidence à la maladie là où cela peut ne pas être un cadre utile pour des groupes spécifiques», a déclaré Lombard.

Par exemple, les données ont montré que les membres d’un groupe en Ouganda avaient des variantes qui protègent contre le paludisme grave, tandis que d’autres groupes vivant dans le même pays n’avaient pas la variante.

Cela pourrait être le résultat, selon l’étude, de la migration relativement récente de membres du groupe non protégé vers des régions de l’Ouganda où le paludisme est endémique.

Le séquençage offre également un aperçu des expansions bantoues – des migrations clés de personnes de langue bantoue qui se sont produites plusieurs fois sur des milliers d’années.

Le séquençage a montré que les groupes bantous d’Afrique orientale et australe avaient des similitudes génétiques avec les locuteurs bantous en Zambie.

Ainsi, alors que des travaux récents ont théorisé au moins une migration bantoue originaire d’Angola, les données génétiques suggèrent que la Zambie pourrait avoir été une étape clé.

Malgré tout le séquençage révèle, Lombard reconnaît que le travail « ne fait que gratter la surface des plus de 2 000 groupes ethnolinguistiques représentés en Afrique ».

À l’avenir, les chercheurs espèrent examiner d’autres types de variations dans les séquences et ajouter des informations provenant de populations non étudiées.

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