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La souche de coronavirus n’a pas muté depuis juin, les nouvelles mutations n’affecteront pas les études vaccinales: étude

La souche A2a se trouve principalement en Inde et peut-être qu’une ou deux mutations auront lieu «ici et là» mais rien de majeur.

Une étude pan-indienne du Département de biotechnologie suggère que la souche A2a de SRAS-CoV-2, qui est le nouveau sous-type de coronavirus le plus important trouvé dans le pays, n’a subi aucune mutation majeure depuis juin et rien n’indique que le vaccin ou la stratégie de diagnostic serait entravée.

Institut national de génomique biomédicale du DBT, Kalyani (Bengale occidental), ainsi que ses organisations sœurs – Institut des sciences de la vie, Bhubaneshwar, Centre pour les empreintes digitales et le diagnostic de l’ADN, Hyderabad, Centre national pour les sciences cellulaires, Pune, Institut des sciences cellulaires et régénératives Medicine (INStem) et le National Center for Biological Sciences, Bengaluru – ont séquencé 1 058 génomes au cours des six derniers mois.

Saumitra Das, le directeur de l’Institut national de génomique biomédicale, a déclaré que les instituts avaient commencé à séquencer le virus dans différentes régions du pays à partir d’avril.

«Au départ, il y avait différentes souches. Mais en juin, nous avons découvert que la souche A2a du virus se trouve plus principalement en Inde », a déclaré Das, dont l’institut a joué un rôle déterminant dans le séquençage d’environ 500 génomes.

« Nous ne voyons aucune mutation majeure qui s’est produite entre juin et maintenant qui peut remplacer la souche A2a … Il n’y a pas une telle indication », a déclaré Das.

Samedi, un communiqué du cabinet du Premier ministre a déclaré: «Deux études pan-indiennes sur le génome du SRAS-CoV-2 (virus COVID-19) en Inde menées par l’ICMR et le Département de biotechnologie (DBT) suggèrent que le virus est génétiquement stable et il n’y a pas de mutation majeure dans le virus. »

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Le mois dernier, le ministre de la Santé de l’Union, Harsh Vardhan, avait déclaré qu’aucune mutation significative ou drastique n’avait été trouvée dans les souches de SRAS-CoV-2 en Inde jusqu’à présent.

La mutation fait généralement référence à la propriété d’un virus de subir des changements lorsqu’il se multiplie et le virus peut développer de nouvelles souches après sa réplication.

Dans certains cas, les nouvelles souches ont tendance à être moins efficaces et donc à s’éteindre rapidement, tandis que dans d’autres cas, elles peuvent devenir plus puissantes et conduire à une propagation plus rapide du virus.

Certains craignaient que toute mutation majeure détectée dans le nouveau coronavirus ne puisse entraver le développement d’un vaccin efficace. Cependant, certaines études mondiales récentes ont indiqué que les vaccins actuellement en cours de développement pour le COVID-19 ne devraient pas être affectés par des mutations récentes.

Le séquençage du génome consiste à déterminer l’ordre des nucléotides d’ADN, ou éléments constitutifs. Cela aide à comprendre comment les gènes travaillent ensemble pour diriger la croissance, le développement et le maintien d’un organisme entier.

Le Département de biotechnologie et le Conseil de la recherche scientifique et industrielle (CSIR), tous deux dépendant du ministère de la Science et de la Technologie, ont séquencé des milliers de génomes à ce jour.

Interrogé sur la question de savoir si la mutation existante affecterait la stratégie de vaccination ou de diagnostic de l’Inde, Das a répondu: « Cela ne devrait pas. »

«Cette mutation ne devrait pas affecter l’épitope antigénique utilisé pour le développement du vaccin. C’est donc également (applicable pour) les diagnostics. En tant que tel, nous ne voyons pas de mutation continue, mais il y aura une dérive », a déclaré Das.

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Il a ajouté qu’il y aura une ou deux mutations «ici et là», mais aucune mutation majeure n’est susceptible de se produire.

Il n’a cependant pas exclu des mutations à l’avenir. «Nous n’excluons pas que cela ne se produise pas à l’avenir, mais nous voulons une surveillance continue.»

Das a déclaré que le plan était de surveiller en permanence les séquences.

En juillet, Rakesh Mishra, directeur du Centre de biologie cellulaire et moléculaire du CSIR, avait déclaré que la souche du nouveau coronavirus dans une majorité de cas en Inde était le «  sous-type  » prédominant trouvé dans d’autres parties du globe, une uniformité qui augure bien. pour l’efficacité d’un vaccin ou d’un médicament développé partout dans le monde.

Selon Mishra, le clade A2a, également la souche la plus prédominante au monde, représente 80 à 90 pour cent des génomes de l’Inde.

Son institut avait jusque-là soumis 315 génomes sur des référentiels de séquences du génome viral du coronavirus et analysé plus de 1700 séquences de virus accessibles au public qui ont été échantillonnées à travers le pays. «Le virus mute à un rythme de 26 fois par an (une fois tous les 15 jours), ce qui est conforme au rythme observé dans le monde car il laisse entrevoir la stabilité du virus. Les chances que les clades existants (sous-type / souche) du virus se transforment en quelque chose de plus dangereux sont très moindres », avait déclaré Mishra à PTI.

«Jusqu’à présent, les mutations analysées dans nos données suggèrent également la même chose – elles sont soit neutres, soit délétères (pour elles-mêmes), et entraînent donc un virus plus faible», a déclaré Mishra.

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